1、殺菌效果：由于立式殺菌鍋利用蒸汽對食品進行殺菌處理，因此溫度和壓力相對穩(wěn)定，進一步保障了殺菌的效果。而臥式殺菌鍋由于加熱方式和管道結(jié)構(gòu)的不同，溫度和壓力可能會存在波動。

2、操作便捷性：由于立式殺菌鍋的結(jié)構(gòu)簡單，操作便捷，適合小型企業(yè)和個體戶使用。而臥式殺菌鍋的結(jié)構(gòu)相對復雜，需要進行更多的操作和調(diào)試，適合中大型企業(yè)使用。

3、節(jié)能環(huán)保性：由于立式殺菌鍋利用U型管或管線圈進行蒸汽傳導，因此能耗和能源利用效率相對較高，更加節(jié)能環(huán)保。而臥式殺菌鍋雖然采用了熱交換器方式進行加熱，但由于結(jié)構(gòu)相對復雜，熱損失和能耗也相對較大。

綜上所述，立式殺菌鍋和臥式殺菌鍋在結(jié)構(gòu)、殺菌效果、操作便捷性、節(jié)能環(huán)保性等方面存在差異。在選擇使用時，應該根據(jù)實際情況進行綜合考慮，選擇最適合自己的殺菌鍋。